Der Weg durchquert von der Grenze aus den Bayerischen Wald bis zur Donau nach Regensburg und verläuft weiter über Eichstätt bis nach Donauwörth zum Anschluss an den Jakobsweg von Bayerisch Schwaben in Richtung Bodensee. Die Strecke liegt somit geographisch gesehen genau auf der Luftlinie Prag-Regensburg - Augsburg - Bodensee - Maria Einsiedeln/Schweiz. Unter dem Symbol des Jakobsweges - der stilisierten gelben Muschel auf blauem Grund - kann man also von Eschlkam aus durchgehend dem Weg über 2825 km bis nach Santiago de Compostela folgen. Auch von Prag aus gibt es bereits eine gut markierte und beschriebene Route- die sogenannte tschechische Südvariante - bis zum Grenzübergang Vseruby/Eschlkam. Für eilige Jakobuspilger wurde parallel zum Ostbayerischen Jakobsweg für Fußpilger auch eine Wegvariante für Radfahrer ausgeschildert. Sie hält sich aus praktischen Gründen an die Radwanderwege der Region, ist jedoch so geführt, dass sie ebenfalls die Stätten religiöser Verehrung, sowie solche von überregionaler historischer, kultureller und touristischer Bedeutung berührt.
